肛瘺需要與以下一些疾病鑒別:第一,肛門部化膿性汗腺炎,是皮膚及皮下組織的慢性炎性疾病,也可以在肛門周圍皮下形成瘺管,但并沒有內(nèi)口。第二,肛門周圍毛囊炎或者癤腫,也是常見的皮膚感染,也有可能會(huì)發(fā)生瘺管,但與肛門不相通。第三,骶尾部囊腫,位置偏高,指診可觸及囊性腫物,但直腸內(nèi)沒有內(nèi)口。第四,會(huì)陰部尿道瘺,是尿道球部與皮膚相通,瘺口內(nèi)有尿液流出。第五,肛周惡性腫瘤,惡性腫瘤也會(huì)形成瘺管,但局部可及堅(jiān)硬腫塊,呈菜花樣。